- 技术简介
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- 实验结果
ATAC-seq (Assay for Transposase Accessible Chro-matin with high-throughput sequencing)是一种在全基因组范围内检测染色质的开放程度的组学技术,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息。
其原理是利用转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。该技术可用于分析开放的染色质区域上可能结合的潜在调控蛋白(如:转录因子和辅因子),用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子。
原文链接:Transposition_of_native_chromatin_for_fast_and_sensitive_epigenomic_profiling_of.pdf
Peak在TSS附近的分布 Peak 中心信号分布图曲线图
Peak在染色体上的分布 Peak在基因功能区的分布
GO富集分析 KEGG富集分析
Motif分析 ATAC-seq与RNA-seq联合分析Venn图