体内RNA亲和纯化（RNA Affinity Purification, RAP）是根据感兴趣的已知RNA序列，设计与RNA序列互补的生物素标记的DNA捕获探针，同时将RNA与蛋白质在体内进行交联，然后使用DNA捕获探针，将与目的RNA结合的复合物沉淀下来，进行LC-MS/MS检测，鉴定出目的RNA的结合蛋白。